Наши инструменты
Наши инструменты содержат уникальные наборы данных, созданные и собранные сотрудниками лаборатории в рамках научных исследований.
Они доступны для ознакомления и использования в образовательных и исследовательских целях.
О разделе
В этом разделе представлены вычислительные инструменты, разработанные в лаборатории для анализа данных в области биоинформатики и биотехнологии.
Каждый инструмент работает на сервере лаборатории и не требует установки.
Пользователь может загрузить свои входные файлы, после чего программа выполнит анализ и предоставит результаты в виде отчёта.
Важно: все пользовательские данные и результаты автоматически удаляются через 24 часа после завершения обработки.
AFPredictor — веб-приложение для геномного скрининга и приоритизации биосинтетических генных кластеров (BGC) вторичных метаболитов микроорганизмов (преимущественно NRPS, PKS и их гибридов) с потенциальной антифунгальной активностью.
Разработчик: аспирант и сотрудник лаборатории Максим Куликов
Приложение доступно по ссылке: AFPredictor — Предсказание антигрибковой активности · Streamlit
EcoPredict — предсказание экологических функций прокариот по протеомным данным.
EcoPredict - нейросеть, предсказывающая потенциальные экологические функции бактерий и архей по их протеомам, не требующая аннотации отдельных белковых последовательностей. Нейросеть обучена на 1300 протеомах предсказывать более 70 уникальных экофизиологических функций или "тегов".